標(biāo)本要求:組織、細(xì)胞、血液、其它
實驗周期:3周~4周
收費(fèi)價格:每個樣品每個基因800元,每個基因1對引物費(fèi)70元
產(chǎn)品介紹:亞硫酸氫鹽處理后測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法是檢測基因甲基化的經(jīng)典方法,其原理為:用亞硫酸氨鈉修飾處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶則不變。隨后設(shè)計BSP引物進(jìn)行PCR,在擴(kuò)增過程中尿密啶全部陣?;癁樾叵汆奏?最后,將PCR產(chǎn)物克隆至載體后進(jìn)行測序,并且與未經(jīng)處理的序列比較,判斷是否CpG位點(diǎn)發(fā)生甲基化,這種方法稱為BSP-克隆測序法。此方法是精確度很高,能明確目的片段中每一個CpG位點(diǎn)的甲基化狀態(tài)。一般會選取10個克隆子測序。
實驗流程
(1) 樣本接收:組織、細(xì)胞、血液、其它
(2) 實驗步驟: DNA提取-亞硫酸氫鹽處理-純化DNA-PCR擴(kuò)增-TA克隆-測序
(3) 實驗結(jié)果:完整項目報告(材料、試劑、儀器、方法、數(shù)據(jù)分析、實驗結(jié)果)
注意事項:
1、組織樣品:新鮮組織放入液氮或-80度保存,組織不少于100mg,低溫運(yùn)輸
2、培養(yǎng)細(xì)胞:通過細(xì)胞計數(shù)取不少于2×106個細(xì)胞于EP管,收集細(xì)胞沉淀后,液氮速凍,低溫保存或運(yùn)輸(-80℃,避免反復(fù)凍融);
3、血液標(biāo)本:以抗凝管保存血樣(4℃保存3~5天,如果要長時間保存需放在-80℃);
4、DNA樣品:純度OD260/280比值為1.8-2.0,濃度≥50ng/ul,體積≥50ul。
5、樣本運(yùn)輸:可選擇以下任何一種方式寄送標(biāo)本
a組織樣本、細(xì)胞樣本以干冰運(yùn)輸;
b.細(xì)胞樣本也可直接寄送培養(yǎng)瓶(密封保證不污染、培養(yǎng)液不漏出);
6、提供詳細(xì)的基因信息, BSP方法要求待測序列在350bp左右。我們會根據(jù)客戶的基因序列信息設(shè)計引物,并在方案實驗過程中隨時與客戶溝通。
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